داستان فیلم بر محور گروهی از دانشمندان می‌چرخد که در درازگودال ماریانا گونه‌های جدیدی را کشف می‌کنند، که بوسیلهٔ پرده حرارتی سولفید هیدروژن پوشیده شده‌است. در بین این موجودات، گونه‌ای از یک کوسه غول پیکر به نام مگالودون وجود دارد، موجودی که میلیون ها سال تصور می‌شد منقرض شده‌است. جوناس تیلور (جیسون استاتهام) کاپیتان نیروی دریایی برای کمک به ایستگاه تحقیقاتی فراخوانده می‌شود، اما خیلی زود هیولا فرار می‌کند و در مسیرش همه چیز را نابود می‌کند، و به این ترتیب یک مسابقه با زمان برای متوقف کردن آن آغاز می‌شود.
