در نینجا شطرنجی ۲ ما دوباره الکس و نینجا شطرنجی را در شکاری دیوانه‌وار برای شرور فیلم اول فیلیپ اپرمینت دنبال می‌کنیم. از آنجایی که اپریمنت موفق می شود از محکومیت زندان در تایلند فرار کند، نینجا شطرنجی دوباره زنده می شود و به دنبال الکس می گردد. آنها با هم و با تمام خانواده الکس اکنون باید به تایلند بروند تا اپرمینت را شکست دهند و در این حین دوستی آنها مورد فشاری شدید قرار می گیرد.
